現在市場に出回っているシェルノサージュは３つ、

シェルノサージュ
シェルノサージュ AGENT PACK
シェルノサージュ RE:INCARNATION

となる。
ダウンロード版だとAGENT PACKは存在しない。
シェルノサージュとAGENT PACKは限定盤と通常版の違いだが、作品中重要な資料とCDが入っている。
ぶっちゃけこれが有ると無いとでは作中のイオンの見方が180度変わる……が、見ないほうがいいかもしれない。一応その内入手する機会はあると思われるので後々でいいだろう。どうしても欲しいならこれを買うといいかもしれないが、後々のDLCをすべて買う必要があると言う欠点がある。

シェルノサージュ RE:INCARNATIONはアップデート版で、今までのストーリーDLCと初回特典DLC、新機能使用権、パッチなどが含まれており、カード版を購入すると一気に容量を節約できる利点がある。
DLCの値段や元々の作品の値段からしてお得といえばお得である。

一番オススメできる購入方法は、やはりRE:INCARNATIONを買うことになる。
間違っても安いからといって無印を買うべきではない。非常に安く売っているならAGENT PACKもお勧めである。